天武天皇の御代（678）、現在の社殿の基が造営されました。
本殿御鎮座以後も広く庶民の信仰を集め、皇室の御崇敬は歴代にわたり、行幸啓は枚挙にいとまなく、国家の重大時には必ず奉幣、御祈願がありました。嵯峨天皇は御杖代（みつえしろ）として皇女有智子（うちこ）内親王を斎王（さいおう）と定め、その制度は以来三十五代、約四百年続きました。